La verdad que nunca he usado ese método de instalar un .zip desde el pc al teléfono vía usb,y no puedo darte una opinión al respecto pero ya que todo se hace vía recovery, creo que las 2 opciones son buenas:
1-O instalas un .zip guardado en tu sd card con el recovery modificado (twrp o cwm) con la opción install zip from sd card.
2-O usas la herramienta Sídeload
Pero yo si tengo posibilidad usaría la 1, para mi es como más directa,menos intermediarios como pc,drivers adb etc.... y total uses la que uses será con la misma rom.Solo cambia si la tienes en la sd o en el pc.
Si tienes memoria libre disponible para copiar la rom a tu teléfono yo usaría la 1 pero claro no te olvides que uses la que uses debes tener flasheado en tu móvil el recovery modificado.
— modificado el 23 may. 2017 1:27:37
Excusatio non petita,accusatio manifiesta!!!.