Samsung Galaxy S4 — Mi S4 no guarda las preferencia de usuario

Buenos días, miren mi problema es el siguiente, desde que actualice a la versión 4.4.2 no me guarda las preferencias de usuario como por ejemplo cuando tocas el numero de un contacto de whatsapp para llamar que te dice que elijas en mi casa hacerlo con la app telefono o nod le pongo siempre telefeno hace como que lo guarda y siempre lo mismo me aparece ese cartelito, asi en todas las app. Ya que tambien lo tengo rooteado le quise dar permiso root al clear master (para poder borrar app preinstaladas, y no me deja me dice que necesita permiso root (cuando ya lo tiene)) y tengo el superSu pro