Motorola Moto E — Root ( cyanogenmod 12.1)

Hola a todos! Es la primera vez que publico, y espero me puedan ayudar:
La cuestión es la siguiente (lo escribiré a detalle para que me puedan ayudar)(soy novato en todos estos temas xd):
1. Hace días rootee mi moto e y le puse cm 12.1, hasta ahí todo estaba bien, entonces al otro día estaba en configuración y como jugando llegue hasta Acerca del dispositivo y al inicio vi que decía actualizaciónes de cm y había una disponible, entonces la descargue y luego de actualizar la rom, entré normal pero note que mi celular ya no estaba rooteado.
Ahí esta mi duda, cada vez que actualice la rom se saldrá el root? O que se saliera el root no es normal?

2. Como puedo guardar la configuración que realice en cm? como el estilo del reloj, botones, gestos, temas y demás, porque cuando actualice la ROM ,todas las configuraciones se regresaron a como estaban y es un poco molesto que al actualizar tenga que volver a configurarlo.
   Gracias de antemano.